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Difference between revisions of "Glycoside Hydrolase Family 115"

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== Family Firsts ==
 
== Family Firsts ==
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== References ==
 
== References ==
 
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#Sinnott1990 Sinnott, M.L. (1990) Catalytic mechanisms of enzymic glycosyl transfer. Chem. Rev. 90, 1171-1202. [http://dx.doi.org/10.1021/cr00105a006 DOI: 10.1021/cr00105a006]
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#   Normal  0          0  2    false  false  false    EN-US  JA  X-NONE                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Fujimoto2011 pmid=   Normal  0          0  2    false  false  false    EN-US  JA  X-NONE                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      21206027
 +
#  Normal  0          0 2    false  false  false    EN-US  JA  X-NONE                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      Kolenová2010 pmid=  Normal  0          0  2    false  false  false    EN-US  JA  X-NONE                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      20804758
 
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[[Category:Glycoside Hydrolase Families|GH115]]
 
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Revision as of 18:41, 11 May 2011

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Glycoside Hydrolase Family GH115
Clan GH-x
Mechanism inverting
Active site residues not known
CAZy DB link
http://www.cazy.org/GH115.html


Substrate specificities

Glycoside hydrolases of this family display alpha-glucuronidase activity. The enzymes possible to release 4-O-methyl D-glucuronic acid from polymeric xylans. The substrate specificity could be distinguished from GH67 enzymes. In contrast to GH67 enzymes which only cleave glucuronosyl linkage at the non-reducing end of xylooligosaccharides, GH115 enzymes remove glucuronic acid from the both terminal and internal regions of xylooligosaccharides and xylans. This kind of substrate specificty firstly demonstrated by an alpha-glucuronidase purified from Thermoascus aurantiacus [1] and N-terminal amino acid sequence of Schizophyllum commune firstly provided [2]. In spite of the N-terminal amino acid sequence of Pichia stipitis did not show significant similarity with the sequence of S. commune, the information lead to find full amino acid sequence and establish this family [3]. It has been demonstrated that these enzymes release 4-O-methyl D-glucuronic acid, the enzyme from Streptomyces pristinaespiralis produced the both 4-O-methyl D-glucuronic acid and non methylated D-glucuronic acid as the reaction product [4].

This is an example of how to make references to a journal article [5]. (See the References section below). Multiple references can go in the same place like this [5, 6]. You can even cite books using just the ISBN [7]. References that are not in PubMed can be typed in by hand [8].


Kinetics and Mechanism

Using 1H NMR spectroscopy and reduced aldopentaouronic acid(MeGlcA3Xyl4-ol) as a substrate, it was demonstrated that both the enzymes from S. commune and P. stipitis releasing 4-O-methyl-D-glucuronic acid (MeGlcA) as its beta-anomer, suggesting a single displacement mechanism [5].


Catalytic Residues

Not identified.


Three-dimensional structures

No 3D-structure is solved for this family of enzyme.


Family Firsts

Normal 0 0 2 false false false EN-US JA X-NONE First stereochemistry determination
1H NMR demonstrated that the released 4-methyl-D-glucuronic acid was a beta anomer and thus that the enzyme is an inverter [9, 10].
First catalytic nucleophile identification
unproved.
First general acid/base residue identification
unproved.
First 3-D structure
Just crystallization of S. pristinaespiralis enzyme is reported [11].

References

  1. Pastoor FJ, van't Klooster AT, and Beynen AC. (1990). An alternative method for the quantitative collection of faeces and urine of cats as validated by the determination of mineral balance. Z Versuchstierkd. 1990;33(6):259-63. | Google Books | Open Library PubMed ID:2082623 [Khandke1989]
  2. 0 0 2 false false false EN-US JA X-NONE Fujimoto2011 pmid= Normal 0 0 2 false false false EN-US JA X-NONE 21206027

    [Normal]
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